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Comunicado de prensa. 03/05/2011

La inmunidad de las plantas se bloquea bajo el efecto de la roya

INRA - CNRS - Universidad Nancy 1 - Universidades de Aix-Marseille I y II


Los genomas de los champiñones responsables de la roya negra del trigo y la roya foliar del álamo han sido descifrados y analizados por un consorcio internacional de investigadores del INRA, el CNRS y las Universidades Henri Poincaré – Nancy 1 y Aix-Marseille I y II (Universidad de Provenza – Universidad del Mediterráneo), así como de centros de secuenciación del Joint Genome Institute y del Broad Institute del MIT y Harvard, el servicio de investigación agrícola del Departamento de Agricultura de Estados Unidos (USDA, por sus siglas en inglés) y la Universidad de Minnesota. Dicho análisis revela la presencia en estos dos champiñones patógenos de un gran número de genes que hasta ahora no se habían detectado en otras especies. Dichos genes permitirán la síntesis de las proteínas utilizadas por los champiñones para neutralizar el sistema inmunitario de sus huéspedes respectivos. Estos nuevos datos servirán para identificar los factores que permiten a las royas esquivar las resistencias a la enfermedad en el trigo y el álamo. Los resultados se han publicado en la edición en línea avanzada de la revista PNAS del 2 de mayo de 2011.

 

Comprender las características biológicas de las propiedades invasivas de los champiñones patógenos de las plantas permite, con el tiempo, plantear soluciones más sostenibles para su eliminación. Las enfermedades que suelen llamarse «royas», causadas por diferentes especies de champiñones microscópicos, provocan daños considerables en numerosas plantas de importancia agronómica como el trigo, la soja, el cafeto o el álamo. Un consorcio internacional de investigadores que reúne a los centros del INRA de Nancy y Versalles, las Universidades de Henri Poincaré - Nancy 1, así como a un equipo mixto CNRS/Universidad de Aix-Marseille, ha secuenciado y realizado, en un nuevo estudio, un análisis comparativo de los genomas de la roya del trigo y el álamo. Dichas enfermedades son provocadas por champiñones denominados «biotróficos»1, esto es, que se alimentan de sus plantas huéspedes sin llegar a matarlas. Estos champiñones debilitan considerablemente a las plantas atacadas y causan una importante disminución de los rendimientos de los cultivos. El crecimiento y la reproducción de las royas dependen totalmente de las plantas para los que son patógenos.

El secuenciado de los genomas de los champiñones responsables de la roya negra del trigo (Puccinia graminis f. sp. tritici) y la roya foliar del álamo (Melampsora larici-populina) ofrece importantes resultados para comprender el carácter parasitario de la roya.

Así, los genomas de las royas tienen tamaños importantes y contienen un gran número de genes (más de 16000 en los dos champiñones). Entre ellos, más de la mitad son nuevos genes que no han sido identificados antes en otros patógenos de las plantas. En particular, los genomas de las royas presentan la particularidad de poder sintetizar más de un millar de proteínas (de las que la mayoría son específicas a las royas), que tienen el perfil típico de los efectores. Dichos efectores son pequeñas proteínas segregadas que podrían neutralizar los sistemas de defensa de las plantas durante la infección. Los genomas de las royas Melampsora larici-populina y Puccinia graminis contienen también una gran proporción de elementos transponibles2, que han contribuido a innovaciones en las royas, en particular, favoreciendo la aparición de nuevos genes durante la co-evolución con las plantas-huéspedes.

Las royas son enfermedades muy difíciles de estudiar, a causa de su modo de vida biotrófico obligatorio. Muy pocas royas han podido ser aisladas y mantenidas artificialmente en laboratorios. El secuenciado de estos dos genomas constituye, de este modo, un avance importante en el ámbito de la patología vegetal, teniendo en cuenta el gran impacto que tienen las enfermedades de las royas en las plantas de grandes cultivos de interés agronómico. Los resultados de este estudio deberían permitir una mejor comprensión de los mecanismos que permiten el establecimiento de la biotrofia.
 


 

Zoom sobre la roya del álamo

El álamo tiene un peso importante en la producción de madera industrial en Europa y su contribución a los sectores energéticos registra una progresión neta. Melampsora larici-populina, agente causante de la roya foliar del álamo, es el principal factor que limita el crecimiento de este árbol. Esta enfermedad causa considerables daños en los bosques de álamos e influye en el rendimiento, con disminuciones en el crecimiento anual de hasta el 50% observadas en los árboles plantados. En varias décadas, el agente de la roya foliar del álamo ha sido capaz de esquivar las resistencias presentes en casi todos los cultivares de álamo utilizados en plantaciones, por lo que parece urgente comprender las bases genéticas de la enfermedad para seleccionar cultivares con resistencias duraderas a la roya. Tras el secuenciado del genoma del álamo en 20063, el del genoma de la roya del álamo debería permitir identificar los factores responsables del establecimiento de la enfermedad y saber cómo estos factores evolucionan para esquivar las resistencias del árbol.
Sobre la base de estos conocimientos, será posible desarrollar métodos de lucha más eficaces y más sostenibles para el medio ambiente a través de la selección genética de árboles resistentes.
Rust disease in poplar leaf. ©Benjamin Petre/INRA


Hoja de álamo afectada por la roya.
©Benjamin Petre/INRA

 

Zoom sobre la roya negra del trigo

La roya negra del trigo causada por Puccinia graminis f. sp. tritici ha sido responsable, en tiempos pasados, de importantes epidemias en cultivos de trigo de todo el mundo. Desde mediados del siglo XX, la utilización de variedades resistentes para el cultivo del trigo permitió limitar los efectos de la enfermedad. Sin embargo, la aparición, en 1999, en Uganda, de la sepa hipervirulenta Ug99 del champiñón y su detección  posterior en Sudáfrica, Yemen e Irán, representa una amenaza para la producción mundial. En efecto, el 85% de las variedades de trigo cultivadas en las principales zonas de producción, son potencialmente sensibles a esta cepa. En la zona más amenazada actualmente (Oriente Medio, Asia Central y subcontinente indio), estas variedades cubren el 90% de las superficies sembradas de trigo. Como respuesta a ello, se ha reactivado un programa mundial contra la enfermedad4.   El secuenciado del genoma de la roya del trigo abre, por tanto, importantes perspectivas para comprender mecanismo que lleva a esquivar las resistencias a esta enfermedad en el trigo y, en particular, para identificar los efectores que manipulan los sistemas de reconocimiento de la planta. Este avance crucial en el ámbito de la genómica de los champiñones debería permitir contribuir a la selección de nuevas variedades de trigo que se opongan a la cepa Ug99 y nuevas cepas agresivas del champiñón. Black rust in wheat plants. © Marc Fouchard/INRA






Plantaciones de trigo afectadas por la roya negra. © Marc Fouchard/INRA

1Las otras familias de champiñones pueden ser necrótrofos (matan a sus plantas huéspedes) o también hemibiotrofos (fase biotrófica seguida de una fase necrotrófica).
2También llamado transposón, un elemento transponible es una secuencia de ADN capaz de moverse y multiplicarse de forma autónoma en un genoma.
3http://www.nancy.inra.fr/la_science_et_vous/genome_du_peuplier 
4http://www.globalrust.org/ 


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Referencia:
Obligate biotrophy features unraveled by the genomic analysis of rust fungi. PNAS advanced online version of 2 May 2011:
doi 10.1073/pnas.1019315108
Sébastien Duplessisa, Christina A. Cuomob, Yao-Cheng Linc, Andrea Aertsd, Emilie Tisseranta, Claire Veneault-Fourreya, David L. Jolye, Stéphane Hacquarda, Joëlle Amselemf, Brandi L. Cantarelg, Readman Chiuh, Pedro M. Coutinhog, Nicolas Feaue, Matthew Fieldh, Pascal Freya, Eric Gelhayea, Jonathan Goldbergb, Manfred G. Grabherrb, Chinnappa D. Kodirab, Annegret Kohlera, Ursula Küesi, Erika A. Lindquistd, Susan M. Lucasd, Rohit Magoj, Evan Maucelib, Emmanuelle Morina, Claude Murata, Jasmyn L. Pangilinand, Robert Parkk, Matthew Pearsonb, Hadi Quesnevillef, Nicolas Rouhiera, Sharadha Sakthikumarb, Asaf A. Salamovd, Jeremy Schmutzd, Benjamin Sellesa, Harris Shapirod, Philippe Tanguaye, Gerald A. Tuskanl,d, Bernard Henrissatg, Yves Van de Peerc, Pierre Rouzéc, Jeffrey G. Ellisj, Peter N. Doddsj, Jacqueline E. Scheinh, Shaobin Zhongm, Richard C. Hameline, Igor V. Grigorievd, Les J. Szabon,m, and Francis Martina
aUnité Mixte de Recherche 1136, INRA/Nancy Université, Interactions Arbres/Micro-organismes, Centre de Nancy, 54280 Champenoux, France; bBroad Institute of Massachusetts Institute of Technology and Harvard University, Cambridge, MA 02142; cDepartment of Plant Systems Biology, VIB, B-9052 Ghent, Belgium; dUS Department of Energy Joint Genome Institute, Walnut Creek, CA 94598; eNatural Resources Canada, Ste-Foy, QC, Canada G1V 4C7; fINRA, Unité de Recherche Génomique Info, 78026 Versailles Cedex, France; gUnité Mixte de Recherche 6098, CNRS–Universités Aix-Marseille I and II, Marseille, France; hGenome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC, V5Z 4S6 Canada; iDivision of Molecular Wood Biotechnology and Technical Mycology, Büsgen-Institute, University of Göttingen, Büsgenweg, 37077 Göttingen, Germany; jCommonwealth Scientific and Industrial Research Organization, Plant Industry, Canberra, ACT 2601, Australia; kPlant Breeding Institute Cobbitty, University of Sydney, Camden, NSW 2570, Australia; lBiosciences Division, Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, TN 37831-6422; mDepartment of Plant Pathology, University of Minnesota, St. Paul, MN 55108; nCereal Disease Laboratory, Agricultural Research Service, US Department of Agriculture, St. Paul, MN 55108


 

Redacción:  Servicio de prensa del INRA

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